Nem volna szabad tisztségében maradnia Ján Sokol pozsony-nagyszombati érseknek – nyilatkozta a Joj pozsonyi kereskedelmi tévécsatorna vasárnapi vitaműsorában Bárdos Gyula, az ellenzéki Magyar Koalíció Pártja frakcióvezetője. Hangsúlyozta ugyanakkor, hogy a szlovákiai magyar párt erre külön nem szólítja fel az egyházi tisztségviselőt.
Sokol 2006. december 27-én a TA3 szlovák hírtelevíziónak adott interjújában azt nyilatkozta: az 1938 és 1945 közti szlovák államban – amely köztudottan a hitleri Németország csatlósának számított – jólét volt. A korabeli rezsim legfőbb képviselőjéről, a katolikus lelkipásztorból államfővé lett Jozef Tisóról (ejtsd: tiszo) is elismerően szólt, noha köztudott, hogy a rendszer például jogaiban korlátozta, majd náci haláltáborokba szolgáltatta ki a szlovákiai zsidókat, romákat és más üldözött társadalmi csoportok képviselőit. Sokol kijelentései nagy felháborodást keltettek Szlovákiában, a zsidó hitközségek központi szövetsége és több roma szervezet, valamint számos közéleti személyiség tiltakozott. Robert Fico miniszterelnök is egyértelműen fasisztának minősítette az akkori szlovák államot, bár sajtóközleménye konkrétan nem utalt arra, hogy az érseki kijelentéseket ítéli el. Időközben újra előtérbe került az is, hogy az érsek állítólag a csehszlovák kommunista rendszer titkosszolgálatának ügynöke volt. Sokol ezt tagadja, és ígéri: kórházi kezelése után a nyilvánosság előtt is cáfolni fogja az ügynökmúltjával kapcsolatos állításokat. A magát kereszténydemokratának valló Bárdos Gyula szerint most esély van a szlovák katolikus egyházon belüli megtisztulásra és a múlttal való határozott szembenézésre, mint ahogy erre a lengyel katolikus egyház példát mutatott.
